Modul Ciele umožňuje vytvárať a systematicky riadiť ciele organizácie, jednotlivých organizačných útvarov alebo zodpovedných osôb. Ku každému cieľu je možné definovať požadovaný výsledok, zodpovednosti a termíny jeho dosiahnutia.
Priebežné sledovanie stavu umožňuje vyhodnocovať plnenie cieľov a včas identifikovať prípadné odchýlky od plánovaného výsledku.
Prepojenie s ostatnými modulmi WebAratu umožňuje začleniť ciele priamo do systému riadenia organizácie a sledovať ich v súvislosti s ďalšími procesmi a aktivitami.